2009年3月，水利部海河水利委员会组织专家对祝官屯枢纽节制闸进行了安全鉴定，该闸被评定为三类闸，建议进行除险加固处理，以消除安全隐患，充分发挥工程效益。

2012年5月18日，水利部以《关于漳卫南运河祝官屯枢纽节制闸除险加固工程初步设计报告的批复》（水总〔2012〕219号）批复工程初步设计，批复总投资5389万元。

设计标准：设计排涝流量1150立方米每秒，设计行洪流量4000立方米每秒，Ⅱ等水闸，其主要建筑物为2级，次要建筑物为3级。

主要建设内容为：对原闸墩拆除重建；闸室段改建为直升门方案及其上部机架桥、工作桥、启闭机房拆除重建；上游铺盖、闸室底板补强及裂缝、地基处理；消力池排水孔修复及表面混凝土修补；海漫翻修、防冲槽抛石；上游翼墙、护坡加固；混凝土防碳化处理；更新闸门及启闭机设备和电气设备；测压管修复；船闸维修；新设综合自动化系统；完善管理设施等。

工程于2012年8月26日开工，2013年12月14日完工，总工期15个月。