卫运河位于漳卫河系中游，自漳、卫两河汇合口的徐万仓起至四女寺枢纽，全长157km。卫运河上承漳河、卫河，下接漳卫新河，为冀鲁两省的界河，左岸为河北省的馆陶、临西、清河和故城四县，右岸为山东省的冠县、临清、夏津和武城四县（市）。 

2013年10月10日，国家发展和改革委员会以《国家发展改革委关于卫运河治理工程可行性研究报告的批复》（发改农经〔2013〕1980号）批准同意卫运河治理工程可行性研究报告。2014年8月21日,水利部以《水利部关于卫运河治理工程初步设计报告的批复》（水总〔2014〕284号）批复工程初步设计，工程初步设计概算总投资为41399万元，主体工程施工工期为36个月。治理标准为50年一遇防洪标准，设计行洪流量4000m³/s；3年一遇排涝标准，排涝流量900m³/s。 

工程建设内容为：河道清淤疏浚31.707km；堤防加高加固88.201km，堤身加筑戗台6.25km；堤身堤基防渗墙0.9km；险工险段整治12处共计8.09km；堤顶防汛道路长202.69km，其中沥青混凝土防汛道路长24.28km，泥结碎石防汛道路长178.41km；涵闸处理161座，其中拆除25座、合并1座后重建24座，加固76座，封堵60座；临清水文站改扩建工程；德州至馆陶微波干线扩容改造及故城河务局通信恢复工程。